正如老话所说“股市有风险，入市需谨慎”。对于深港通，业内专家提醒，深港通开通后切忌盲目入市。除了机会和利好，也应该注意可能带来的其它问题。
“长期来看，深市中小板、创业板或将迎来突破性的发展。但短期来说，在深港两地资金流动差异的背景下，深市中小板、创业板或会出现一波低潮。”宋清辉对记者指出。
另外，国际化的风险也是业内人士普遍强调的问题。香港是一个高度开放的市场，这意味着港股更容易因为国际环境而上下波动，进而影响到投资者的“港票”。
中研普华研究员危仁鹏对《中国产经新闻》记者进一步表示道，香港市场中国际投资者及国际资金流动频繁，国际金融风险及汇率风险较大。需要指出的是，在目前政策监管还不尽完善的背景下，很多中小投资者的权益可能不易被保护。
与此同时，宋清辉指出，港股中T+0的交易制度和无涨跌幅限制，可能会导致港股相关个股下跌的风险巨大。而“仙股”问题，也尤其值得内地投资者关注。
记者发现，“仙股”最初源于香港股市，特指市值跌至l元以下的股票。“仙股”实际的投资价值并不大，但却很适合作为一些公司借壳上市的“壳”。因此，某“仙股”一旦成为上市“壳”，就会股价翻涨，投资者也会随之获利。
但是，“内地投资者见到一元钱的股票切莫‘心动’，否则就会‘心疼’。”宋清辉对记者如此说道。对于一般散户来说，还是应观望为主，切勿手痒投机。
至于如何应对深港通可能带来的风险和问题，赵欢认为，基于两地市场规则和制度的差异，深交所在深港通相关业务规则中其实已有完善,比如：明确规定深股通A+H股公司应遵循两地同步停牌原则，并强调应采取必要措施尽可能实现同步复牌，确保投资者顺利进行交易等。
另一方面，宋清辉强调，做好内地投资者教育很有必要。内地投资者应该多掌握港股的信息资讯，了解两地差异，提前做好“功课”。
在港股通机制下，投资者需要注意哪些事项？
投资者需要注意的事项包括但不限于：
(1)订单类型。 在试点初期，港股通投资者在联交所开市前时段仅可以输入竞价限价盘，在持续交易时段仅可以增强限价盘进行买卖。
(2)额度控制。 内地投资者应当充分了解因港股通额度控制可能造成的买单交易无法及时执行，而遭受损失的风险。
(3)交易日。 香港与内地A股市场的交易日并不完全一致。沪港通在沪港两地均为交易日且能够满足结算安排时开通，投资者在参与港股通交易时需要充分了解。
(4)货币兑换。 作为港股通标的的联交所上市公司股票以港币报价，以人民币交收。此外，因港股通相关结算换汇处理在交易日日终而非交易日间实时进行，所以，投资者要关注由此产生的人民币兑港币在不同交易时间结算可能产生的汇率风险。
(5)投资标的。 投资者可能面临因标的证券被调出港股通标的范围而无法继续买入的风险以及由此可能遭受的经济损失。
