如果未来在A与B之间出现股权确认纠纷时，法院应如何判决呢？

一般情况下，如果双方是有委托代持协议的，一般即按照委托代持协议来认定。如果双方没有签订明确的委托代持协议，但A能举证：

1、其他股东或职工知道实际出资是他出的；

2、在经营管理过程中，B从未参与过公司管理或主张过任何股东权利。基本也能认定A才是实际股东，B不过是代持股东。