以下时间源于上海证券交易所的《沪港股票市场交易互联互通机制试点实施细则（征求意见稿）》和中国结算的《沪港股票市场交易互联互通机制试点登记、存管、结算业务实施细则（征求意见稿）》，并非最终定案。该征求意见稿尚需在向市场广泛征求意见的基础上予以进一步修改完善，并需与联交所等相关各方协商一致，并报监管部门批准后才能最终确定。
1.投资者买卖港股通股票的交易时间。
投资者买卖港股通股票的交易时间应遵守联交所规定，即交易日的9:00至9:30为开市前时段（集合竞价），其中9:00至9:15接受竞价限价盘；9:30至12:00及13:00至16:00为持续交易时段（连续竞价），接受增强限价盘。撤单时间为9:00-9:15；9:30-12:00；12:30-16:00。
2.联交所开市前时段。
联交所开市前时段用以确定开市价。
开市前时段是在早上开市前增设的交易时间，联交所参与者可在该段时间将买卖盘输入交易系统做单一价格竞价。
在开市前时段，买卖盘积累到一段时间后，会在预先设定的对盘时段中对盘（即报价撮合），也就是买卖盘会以买卖盘类别、价格及时间等优先次序按"最终参考平衡价格”顺序对盘。
在开市前时段，交易系统只接受输入“竞价盘”及“竞价限价盘”指令。其中，港股通投资者只可以输入"竞价限价盘"。输入交易系统的买卖盘价格不可偏离上日收盘价或按盘价（最近参考平衡价）9倍或以上及少于九分之一或以下，每个买卖盘不得超过3000手股份。开市前时段又分为以下的交易时段。
开市前时段的交易时段
投资者可以通过联交所网站“市场运作”项下的“证券交易运作”内“交易机制”栏目，了解更详细的交易规则与机制。
3.联交所持续交易时段。
每个交易日的上午9:30至中午12:00、中午12:00至13:00（延续早市）及下午13:00至16:00是联交所的持续交易时段。其中，12:00至13:00为延续早市时段，只适用于指定证券，而港股通股票不包括在内，因此对于港股通投资者而言，在这一时段是无法参与交易的。
在持续交易时段，一方面交易系统会按照价格优先、时间优先的原则成交；另一方面，交易系统只接受“限价盘”、“增强限价盘”及"特别限价盘”。注意，港股通投资者仅可输入"增强限价盘”，而不可输入“特别限价盘”。
在此时段，输入交易系统的买卖盘价格不可偏离按盘价（最近参考价）9倍或以上及少于九分之一或以下。同时，每个买卖盘的数量不得超过3000手股份。
4. 节假日期间，沪港通交易的安排如下。
沪港通业务将仅在沪港两地均为交易日且能够满足结算安排时开通。具体交易日安排，将由两所证券交易服务公司对市场公布。沪港通开通当年的交易日安排将在开通之前向市场公布。
