机械行业
机械行业中，港股投资者更看重市盈率、每股收益及每股股利，而沪股投资者更偏好于股本较小的公司。因此，沪股通中每股收益、每股股利比较稳定且市盈率较低的公司对港股投资者而言较有吸引力。而港股通的机械行业中小盘股有望提升估值水平。
汽车行业
汽车行业中，A股有客车上市公司(例如宇通客车)， 且零部件公司比较多。港股有豪华车相关的上市公司，包括豪华车整车(例如华晨中国)和经销商(例如正通、宝信)。A股和港股两者整体估值相差不大，但存在结构性差异，沪股通的乘用车估值比港股通便宜;而在商用车、零配件、销售服务等子行业，沪股通汽车股估值.比港股通贵，在种类构成上，港股汽车股中乘用车和商用车品种相对稀缺，沪股通汽车股中销售与服务品种相对稀缺。
医药行业
A股医药行业估值整体来说高于H股医药板块的估值。A股医药上市公司很多(龙头股、中小盘股、中医、西医齐全)，所以A股的投资者相当关注此板块，研究也比较深人。沪深港通开放使得内地投资者有机会来关注H股医药板块，有利于提升H股医药上市公司的估值。同时，A股投资者喜爱成长性高的中小盘医药股，而港股投资者较不熟悉医药股。沪深港通使得海外资金也想增加对中国医药行业的了解，因而有可能提升港股医药行业的估值水平。
