2006年建立的依托于代办股份转让信息系统的中关村科技园非上市股份有限公司股份报价转让系统(简称“中关村报价转让系统")，在证券实践中被称为“新三板"。目前作为新三板市场主要持续性企业资源的是在中关村园区注册的、属于高新技术企业的非上市股份有限公司。但是，“园区”的范围地域限制在某种程度上也成为了代办股份转让系统持续发展的“短板”。2012年8月，新三板扩容正式获批，首批扩大试点除中关村科技园区外,新增上海张江高新产业开发区、东湖新技术产业开发区和天津滨海高新区。在这些园区的企业都可以到新三板挂牌上市。
2013年1月16日,全国中小企业股份转让系统正式揭牌运营,全国中小企业股份转让系统是经国务院批准设立的全国性证券交易场所,全国中小企业股份转让系统有限责任公司为其运营管理机构。全国中小企业股份转让系统有限公司是首个全国性场外市场证券交易场所，因其所在地为北京，相对于上海证券交易所和深圳证券交易所，亦称为“北京证券交易所”，这将是中国真正的“三板”市场，有别于此前的“新三板"。
2012年9月20日，公司在国家工商总局注册成立,注册资本30亿元。上海证券交易所、深圳证券交易所、中国证券登记结算有限责任公司、上海期货交易所、中国金融期货交易所、郑州商品交易所、大连商品交易所为公司股东单位。全国中小企业股份转让系统正式揭牌运营后，全国性场外市场的运作平台,将由证券业协会自律管理的证券公司代办股份转让系统转为国务院批准设立的全国中小企业股份转让系统有限公司:挂牌公司的准人和持续监管将纳人证监会非上市公众公司监管范围;市场运行制度将由证券业协会发布的试点办法转为全国中小企业股份转让系统业务规则。全国中小企业股份转计系统正式揭牌运背标志着非上市公司股份转让的小范围、区域性试点将逐步走向面向全国的正式运行，全国性场外市场亦将从试点阶段走向规范运转阶段。
2012年10月，中国证监会发布《非上市公众公司监督管理办法》,确定了非上市公众公司的范围，提出了公司治理和信息披露的基本要求，明确了公开转让、定向转让、定向发行的申请程序。该《办法》的出台标志着将非上市公众公司监管纳入法制轨道,也意味着我国多层次资本市场，尤其是新三板、三板的建设向前大大推进了一步。
2013年1月8日，中国证监会公布实施《非上市公众公司监管办法》的配套规则《非上市公众公司监管指引第1号一信息披解》《非上市公众公司监管指引第2号一申请文件》 和《非上市公众公司监管指引第3号一章程必备条款》。信息披露指引对非上市公众公司公开转让说明书，定向发行说明书和定向转让说明书，不再分别出台专项文件，而是统一对非上市公众公司的信息披露制定最低标准。
指引主要规定有:第一,披露内容主要包括公司基本情况、业务与产品、财务状况;第二,年报和半年报的披露内容比照指引进行;第三，公司可以自主约定和选择信息披露平台;第四，公司和董事、监事、高管有保证披露内容真实准确完整的义务。信息披露指引还明确,股票在依法设立的证券交易场所公开转让的非上市公众公司，应当通过证券交易场所要求的平台披露信息。依法设立的证券交易场所可以在指引的基础上,对股票公开转让的非上市公众公司制定更详尽，更严格的信息披露标准，公司应当按照从高从严的标准遵守证券交易场所的相关规定。申请文件指引规定，非上市公众公司申请核准时需要编制和报送申请文件目录，公司应当保证申请文件内容真实、准确、完整,不存在,虚假记载、误导性陈述或者重大遗漏。证券公司、证券服务机构及人员应当做到勤勉尽责、诚实守信，并对其出具的相关文件及申请文件中引用内容的真实性、准确性、完整性承担相应的法律责任。依法设立的证券交易场所可以要求股票公开转让的非上市公众公司报送除上述文件之外的其他文件，公司应当遵守证券交易场所的相关规定。章程必备条款指引采用必备条款的形式，内容主要体现《 监管办法》关于公司治理的规定，不做具体条款规定，只做原则性要求，公司根据自己的实际情况进行具体落实。三项监管指引作为《监管办法》配套规则发布后，非上市公众公司监管制度初步建立。
2013年1月18日，中国登记结算有限责任公司正式发布《非上市公众公司股份登记存管业务实施细则(试行)》,又一非上市公众公司监管配套措施出台。该《细则》主要明确了股份初始登记、变更登记及证券查询、权益分派等登记存管服务的业务办理流程和需提供的申请材料。非上市公众公司通过中国证监会核准后，即可以向中国结算申请办理股份登记存管手续，中国结算根据非上市公众公司申报的股份持有明细数据，办理股份初始登记。
2013年2月2日,中国证监会网站公布了《全国中小企业股份转让系统有限责任公司管理暂行办法》，自公布之日起实施。该《暂行办:法》规定，在该转让系统挂牌股票转让，可以采取做市方式、协议方式、竞价方式或证监会批准的其他转让方式。《 暂行办法》同时明确,在证券公司代办股份转让系统(俗称“老三板")的原STAQ、NET系统挂牌公司和退市公司及其股份转让相关活动，由全国中小企业股份转让系统有限责任公司负责监督管理。
从2006年1月中关村科技园区非上市股份有限公司股份报价转让试点工作启动，到2012年年底全国股份转让系统挂牌公司已达200家,其中北京中关村175家，天津滨海7家，上海张江8家,武汉东湖10家。挂牌公司总股本为55. 27亿股，年度交易量为1145.5万股，成交.金额为5.84亿元。挂牌公司中，具有高新技术企业资格的占90%。43家挂牌公司完成52次定向增资，累计募集资金22. 82亿元，平均增资市盈率22倍。Wind统计显示，以2011年年报和2012年平均转让价格为计算基数,2012年同期，挂牌企业股份转让成交价的平均市盈率为59.3倍;2012年全年“新三板”挂牌企业报价转让的平均市盈率为46倍。D这样的市盈率尽管比主板、中小板和创业板要低一些， 但也是一条不错的退出途径。
新三板挂牌的条件非常宽松，甚至亏损也能挂牌。例如，2012 年9月7日挂牌的武大科技，其2012年中报业绩显示，当时该公司的营业利润仍为-40.6万元，每股收益仅有2分钱, 4元/股的成交价格，市盈率已达到200倍。同样，天一众合2012年中报显示，当时该公司的营业利润和净利润均为亏损，分别为-579.33万元和-213.2万元，每股收益-0.06元。天一众合于2011年5月份在“新三板"挂牌,挂牌后，天一众合仅在2011年12月就有过一次30万元的股份转让成交。
