收盘价的计算
沪港股市收盘价的计算方式存在差异，沪股是选取证券最后1笔较以前1分钟所有交易的成交量加权平均价(含最后1笔交易)，而港股是选取最后1分钟的交易时间内，每隔15秒所记录的5个按盘价的中位数作为该股票的收市价。
委托/申报的撤销、修改与有效期
沪港股市委托/申报的撒销和修改存在差异。沪市除9:20~9:30间交易主机不接受撤单申报，其他交易时间内都能撤销未能成交的申报。同时，已申报订单不得更改申报价格或申报数量，必须采用先撤单再申报的方式修改订单。
香港股市除9: 15~9: 30不得修改和撤销买卖盘申报、12: 30~1: 00只可撤销不可修改买卖盘申报外，其他交易时间不仅能撒销未成交申报，还可以修改申报数量和价格。虽然香港股市允许修改订单，但是港股通业务方案规定，基于额度控制原因，港股通投资者不得修改订单，必须采用先撤单再申报的方式修改订单，这是港股通交易机制的特殊安排，与香港股市基本交易机制不同。沪港两市的委托/申报均为当日有效。
错误交易的处理
两市对错误交易的处理存在一定差异。上交所对于“因不可抗力、意外事件、交易系统被非法侵人等原因造成严重后果的交易”，保留采取适当措施或认定无效的权力，对显失公平的交易，也保留采取适当措施的权力。而港市交易中的意外错误输人，需要经买卖双方协商达成撤销交易的共识并通报交易所，交易所予以考虑审批。这意味着港市错误交易的处理主要取决于买卖双方协商。
