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未办理股权转让后工商变更手续不影响股权转让协议的效力。
如股权转让协议不属于合同法中规定的无效情形，且不违反股权转让的法律规定，按照《合同法》规定，依法成立的合同，自成立时生效。双方当事人就股权转让达成一致，签署股权转让合同，合同即已成立。
一般有限公司股权转让的流程：股东签署股权转让协议、受让方支付转让对价、股东名册变更、公司章程变更、工商登记变更。
股东名册变更、公司章程变更和工商登记的变更是股权转让协议的履行内容，并非生效要件，是否变更不会影响股权转让合同的效力。
如转让方不按照约定办理变更手续，受让方可以按照转让协议中约定的罚则内容要求其进行赔偿，或者是通过法律途径要求其履行约定办理变更手续；
如拒不履行，可以撤销股权转让合同，要求其返还股权转让价款，甚至可以要求支付同期银行存款利息。
