(1)财务报表本身的局限性。
财务报表是财务会计的产物，因而财务报表信息是在一系列会计准则或会计制度的规范下由会计核算系统所生成的，并且受制于会计假设和会计原则的约束，尤其是受历史成本和权贵发生制的约束。从这种意义上讲，财务报表并不是企业“经济真实”的真正反映，并且财务报表本身也存在众多的局限性。
首先，现行财务报表所提供的财务信息主要反映已发生的历史事项，它与使用者决策所需要的有关未来信息的相关性较低。由于财务报表是报告历史事项，财务分析是对过去事项的检验，因而这些信息无论何时运用于决策过程中，都存在着一个重要假设，即过去是预测未来的合理基础。通常一般的分析不能解释财务比率和比较分析所显示的问题，而要找出答案，则必须进一步进行分析，并掌握未来财务报表要揭示的其他信息，如技术的发展、通货膨胀的影响。
其次，现行财务报表主要反映能用货币计算的信息，而无法反映许多对企业财务状况和经营成果产生重大影响的重要信息，如企业的人力资源状况、市场占有率等信息。
再次，现行财务会计准则对同一经济业务允许有不同的处理方法，并需对许多事项进行估计，从而给人为操纵财务报表数据提供了机会，降低了财务信息的可比性。
最后，稳健原则要求预计可能的损失而不预计可能的收益，有可能夸大费用，少计资产和收益，而使报表数据不实。
正是由于财务报表存在着这些局限性，因而在进行财务分析时，必须对财务报表本身的特征有全面、明确的了解，否则财务分析就成为无源之水、无本之木，达不到财务分析的目的。
(2)财务报表分析的评价标准。
财务分析的一个重要前提是要有共同的比较基础。财务比率虽克服了财务报表只揭示绝对数的缺陷，但比率本身并不能充分说明问题，财务比率等财务指标只有与特定的标准进行对比之后，才能作为判断的基础。财务分析的标准包括定量标准和定性标准，这两种标准互相配合，共同组成财务分析的标准体系定量标准，一般包括企业的历史指标、企业的计划指标及行业标准。其中行业标准代表着企业所在行业的平均水平或先进水平，因而是分析人员应首先考虑的评价标准。
定性标准，是指那些不能用数量表示的规定、计划和目标等，如企业文化、管理人员的素质。企业生产经营环境的复杂化，使定员标准经常不能全面反映企业的经营状况，而必须结合定性标准的应用。在财务分析中，将这两种标准结合起来运用能更好地反映企业的真实状况，获得决策有用的信息。
(3)正常经营事项与非正常经营事项。
正常经营事项是指企业只要持续经营，这些事项就会持续发生，如各种生产经营活动；非正常经营事项是指那些偶然发生的事项，如接受捐赠、自然灾害等。这两类事项对企业的生产经营状况的影响有着本质的区别，正常经营事项是经常性的、持久的，与这类事项有关的信息是对未来进行预测的基础；非正常经营事项只是偶然发生的、暂时的现象，其对企业的影响一般是当期的，与这类事项有关的信息的决策相关性较差。由此可见，在财务分析时，要注意区分这两类事项的不同影响。
(4)报表数据必须结合附注内容进行分析。
报表数据是企业已发生的经济业务，用货币高度概括的结果，数据是报表项目的总括概念。因而，如果单纯用总括数据进行分析，就可能无法得到决策有用的信息。如财务报表中揭示的存货信息，实际上是众多产成品、半成品、原材料等明细科目汇总而成的，因而在财务分析时，必须结合附注中存货的构成进行分析。因为存货中90%是产成品与原材料，对企业的影响是完全不同的。产成品比重过大，则可能意味着市场产品滞销，企业的经营风险增大；而原材料比重较大，则可预示着企业的发展前景较好。又如对应收账款的分析，必须结合报表附注中的账龄分析表，分析应收账款的可收回性，否则就会高估应收账款的价值。总而言之，报表附注是财务报表的必要补充和说明，在进行财务分析时，必须将报表数据与附注内容结合起来进行，才可能获得相关信息。
