合并财报是关于企业集团的财务状况和经营成果的全面汇总表，就了解这一整体财务状况和财务成果而言，该表有非常重大的作用。但也应看到合并财报反映的会计信息有一定的局限性，了解这些局限性，对于财报使用者正确做好决策，有很大帮助。
1、合并财报无法提供母公司与子公司本身的财务状况和经营成果
合并财报为使用者提供了整个企业集团的财务状况和经营成果信息，但是作为母公司和子公司各自的债权人，不可能从合并财报中取得多少对他有用的资料，因为每个企业都是独立的法人，各企业本身的资产、负债、所有者权益、收入和费用等有用的资料只能通过本身编制的个别财报反映出来。例如，母公司向子公司购进13 000元的商品，款项未付，对于这笔业务，母公司将会形成增加自己的一笔债务，而子公司则会因为该业务形成一笔债权，双方均在各自的财报中披露该信息，但由于这笔业务是企业集团内部发生的购销业务，被抵销后，在合并财报中是无法反映出来的。
因而，通过合并财报，母、子公司的债权人是无法看清母公司与子公司各自的债务状况和偿债能力、经营状况和获利能力的。
2、根掘合并财报资料进行比率分析也会形成错误影响
报表使用者在阅读财报时，习惯于用比率进行分析。如存货周转率、流动比率等。由于各项比率是根据合并财报中的综合数字计算的，所以既不能反映子公司的盈利能力，也不能表明母公司的经营绩效。
例如，母公司流动资产180万元，子公司流动资产50万元，母公司流动负债60万元，子公司流动负债40万元，通过计算可知母公司和子公司的流动比率分别为3.0(180/60）和1.25(50/40），而合并后的流动比率为2.3(230/100）。透过合并流动比率既不能反映母公司较高的流动比率，也没有体现出子公司较低的流动比率。
3、母公司的股东仅从合并财报中取得的资料也有限
因为合并财报并不把母公司作为主体来反映其财务状况，而是把母、子公司作为一个会计主体来反映，所以揭示不出母公司在子公司的投资占母公司全部资产的比率和母公司其他的一些经济情况，合并报表所揭示的会计数据只能提供整个集团的财务信息，有些数据并无真实的经济意义。
例如，合并资产负债表中的合并资产并不是母公司能动用的可以用来偿还其债务的资产，所反映的负债也并非都需要母公司进行偿付:合并利润表中的利润并不反映母公司的利润，因为在合并利润表中，－般也包括子公司的利润，只是没有特别明显标示出来；但子公司的利润在未经作为股利转给母公司之前是不能作为母公司支配的，也并非母公司现实拥有的，所以作为独立法人，母公司与子公司相应都须编制反映个体情况的财报。
4、有境外子公司的企业集团所编制的合并财报数据不能反映真实的经济信息
企业集团的子公司如果设在中国境外，其所编报的财报是用当地的货币作为记账本位币编制的，当编制合并财报时，往往需按规定的汇率对不同国家的货币进行折算成人民币金额。
由于在不同的国家和地区．以及不同的时间里，货币的购买力水平是不同的，通过人为的方式，使用单一汇率将多种货币折算为单一货币。在经济上没有什么实际意义，尤其是在外汇市场汇率波动幅度较大时，不能准确列示企业集团的实际情况，容易误导财报阅读者作出错误决策。
