当然影响。股权转让的决议被判决无效，此时转让行为丧失了依据，应当恢复原状，即已转让的股权要再转让回来。
私法自治是民事主体从事民事法律行为的基本原则，任何自然人、法人或其它组织可以自由处分自己的权利。但这种自由处分也要受到一定的限制，即不得侵犯国家以及社会公共利益，也不得侵犯他人的合法权益。侵犯公共利益的行为无效，侵犯到他人合法权益的，他人可以要求损害赔偿。
通常法院是极少判决市场主体的行为无效的。
但也可能存在个别情形：
一、公司的决议行为违反了公司章程，实际并非是公司权力机关作出的。转让股权的行为通常属于公司的重大事项，除非公司章程有特殊规定，一般需要股东大会作出决议。但在董事会或个别大股东控制公司的情形，董事会或大股东可能未经合法程序而擅自作出决议，这个时候的决议很可能会被法院判决无效。
二、股权转让行为可能侵害到公共利益。对于有些涉及社会公共利益的公司，如水电行业，有时候转让股权的行为就可能侵害到公共利益，此时必然会被判决无效。
但在股权转让仅侵害第三人利益的场合，公司决议并不一定会被判决无效，而是第三人可以请求撤销公司决议，或者要求损害赔偿，决议被撤销的，自始无效。
