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尽管ETF套利业务存在发掘多种盈利机会的能力,但由于其整个过程涉及多只股票、多个环节等不确定因素，因此在实战中也存在一些风险点，需要认真把握。其中最主要的风险如下:

1.方向性风险

对于一些方向性的操作，如果预期与实际走势正好相反，则必然存在亏损，因此对于方向性的操作，建议是在把握比较大的情况下进行交易;对于看多的情况交易，主要用于涨停或者停牌股票使用。

2.延时风险

由于部分个股的流动性比较差，会带来操作上的延时风险。建议对ETF及一篮子股票跟踪研究，了解其流动性,同时选择比较活跃的ETF品种作为交易对象。

3.冲击成本

由于部分ETF交易的活跃度不够，而套利交易至少要进行一个申赎单位的ETF买卖操作,会对市场价格造成冲击，并影响套利的收益。基金价格0.001元的变化，对于套利收益的影响都是比较大的。如考虑延时分批进行ETF买卖，但又会存在延时风险。

4.持仓风险

对于ETF的套利操作，应该注意尽可能避免被动持仓的情况，对于由于某些原因而被动的持仓，应该尽可能在第一时间卖出，不要企图获得额外的收益。从套利的角度,应该是风险小的交易行为，不要变成自营投资持仓的方式。