通过对现金流量表的分析，投资者能够获取大量有关企业财务方面，尤其是关于企业现金流动方面的信息，但是，这并不意味着对现金流量表进行分析就能够替代其他会计报表的分析。事实上，现金流量表分析只是企业财务分析的一个方面。而且，同任何分析一样，现金流量表分析也有其局限性，这主要表现为：
（1）报表信息的有效性。报表中所列出的数据，反映了企业过去会计事项影响的结果，根据这些历史数据计算得到的各种分析结果，对于预测企业未来的现金流动，只有参考价值，并非完全有效。
（2）报表信息的可比性。可比性一般是指不同企业，尤其是同一行业的不同企业之间，应使用相类似的会计程序和方法，将不同企业的现金流量表编制建立在相同的会计程序和方法上，便于报表使用者比较分析不同企业在不同时期的偿债能力和现金流动状况的强弱和优劣。对于同一个企业来说，虽然一致性会计原则的运用使其有可能进行不同期间的比较，但如果企业的会计环境和基本交易的性质发生变动，则同一个企业不同时期财务信息的可比性便大大减弱。对于不同企业来说，它们之间可比性比单一企业更难达到。由于不同企业使用不同的会计处理方法，例如，存货的计价、折旧的摊提、收入的确认以及支出资本化与费用的处理等方法不同，为运用各种分析方法对各个企业的现金状况进行比较带来了一定的困难。
（3）报表信息的可靠性。可靠性是指提供的财务信息，应做到不偏不倚，以客观的事实为依据，而不受主观意志的左右，力求财务信息准确可靠。事实上，编制现金流量表所采用的各种资料的可靠性往往受到多方面的影响，使得报表分析同样显得不够可靠。
（4）报表信息的局限性。现金流量表在揭示非现金交易产生的现金流量信息时，仍有一定的困难。比如用股票换取固定资产、发放股票股利、将负债转化为权益等等，这些在当期都不会影响现金的净流量，但它们会对企业的财务状况和未来的现金流量造成重大影响：如果在现金流量表中加以列示，又会与现金净流量的概念相违背。在表中过多反映这类信息，又会使现金流量表变成一张实际型的财务状况变动表。
由此可见，对于现金流量表，我们也要辩证地看，辩证地分析，不能忽视它的意义，但也不能夸大它的作用。尤其重要的是，它必须与资产负债表和损益表结合起来分析，才能取得最佳的效果。
